Delta实战 | 为Delta新增Upsert(Merge)功能

栏目: 数据库 · 发布时间: 5年前

内容简介:今天花了一早上以及午休时间,终于把delta的Upsert功能做完了。加上上周周四做的Delta Compaction支持,我想要的功能基本就都有了。Delta的核心是DeltaLog,其实就是元数据管理。通过该套元数据管理,我们可以很容易的将Compaction,Update,Upsert,Delete等功能加上,因为本质上就是调用元数据管理API完成数据最后的提交。Upsert支持流式和批的方式进行更新。因为受限于Spark的SQL解析,大家可以使用Dataframe 或者 MLSQL的方式进行调用。

前言

今天花了一早上以及午休时间,终于把delta的Upsert功能做完了。加上上周周四做的Delta Compaction支持,我想要的功能基本就都有了。

Delta的核心是DeltaLog,其实就是元数据管理。通过该套元数据管理,我们可以很容易的将Compaction,Update,Upsert,Delete等功能加上,因为本质上就是调用元数据管理API完成数据最后的提交。

代码使用方式

Upsert支持流式和批的方式进行更新。因为受限于Spark的 SQL 解析,大家可以使用Dataframe 或者 MLSQL的方式进行调用。

批使用方式:

val log = DeltaLog.forTable(spark, outputDir.getCanonicalPath)
val upsertTableInDelta = UpsertTableInDelta(data, Option(SaveMode.Append), None, log,
            new DeltaOptions(Map[String, String](), df.sparkSession.sessionState.conf),
            Seq(),
            Map("idCols" -> "key,value"))
val items = upsertTableInDelta.run(df.sparkSession)

唯一需要大家指定的就是 idCols, 也就是你的表的唯一主键组合是啥。比如我这里是key,value两个字段组成唯一主键。

流使用技巧是一模一样的,只需要做一点点修改:

UpsertTableInDelta(data, None, Option(OutputMode.Append())

UpsertTableInDelta 根据你设置的是SaveMode还是OutputMode来看是不是流写入。

MLSQL 使用方式

写入数据到Kafka:

set abc='''
{ "x": 100, "y": 201, "z": 204 ,"dataType":"A group"}
''';
load jsonStr.`abc` as table1;

select to_json(struct(*)) as value from table1 as table2;
save append table2 as kafka.`wow` where 
kafka.bootstrap.servers="127.0.0.1:9092";

使用流程序消费Kafka:

-- the stream name, should be uniq.
set streamName="kafkaStreamExample";

!kafkaTool registerSchema 2 records from "127.0.0.1:9092" wow;

-- convert table as stream source
load kafka.`wow` options 
kafka.bootstrap.servers="127.0.0.1:9092"
and failOnDataLoss="false"
as newkafkatable1;

-- aggregation 
select *  from newkafkatable1
as table21;

-- output the the result to console.
save append table21  
as rate.`/tmp/delta/wow-0` 
options mode="Append"
and idCols="x,y"
and duration="5"
and checkpointLocation="/tmp/s-cpl6";

同样的,我们设置了idCols,指定x,y为唯一主键。

然后查看对应的记录变化:

load delta.`/tmp/delta/wow-0` as show_table1;
select * from show_table1 where x=100 and z=204 as output;

你会惊喜的发现数据可以更新了。

实现剖析

一共涉及到三个新文件:

org.apache.spark.sql.delta.commands.UpsertTableInDelta
org.apache.spark.sql.delta.sources.MLSQLDeltaDataSource
org.apache.spark.sql.delta.sources.MLSQLDeltaSink

对应源码参看我fork的delta项目: mlsql-delta

https://github.com/allwefantasy/delta

第一个文件是实现核心的更新逻辑。第二个第三个支持Spark的datasource API来进行批和流的写入。

这篇文章我们主要介绍UpsertTableInDelta。

case class UpsertTableInDelta(_data: Dataset[_],
                              saveMode: Option[SaveMode],
                              outputMode: Option[OutputMode],
                              deltaLog: DeltaLog,
                              options: DeltaOptions,
                              partitionColumns: Seq[String],
                              configuration: Map[String, String]
                             ) extends RunnableCommand
  with ImplicitMetadataOperation
  with DeltaCommand with DeltaCommandsFun {

UpsertTableInDelta 集成了delta一些必要的基础类,ImplicitMetadataOperation,DeltaCommand,主要是为了方便得到一些操作日志写入的方法。

saveMode 和 outputMode 主要是为了方便区分现在是流在写,还是批在写,以及写的模式是什么。

assert(configuration.contains(UpsertTableInDelta.ID_COLS), "idCols is required ")

    if (outputMode.isDefined) {
      assert(outputMode.get == OutputMode.Append(), "append is required ")
    }

    if (saveMode.isDefined) {
      assert(saveMode.get == SaveMode.Append, "append is required ")
    }

限制条件是必须都是用Append模式,并且idCols是必须存在的。

saveMode match {
      case Some(mode) =>
        deltaLog.withNewTransaction { txn =>
          actions = upsert(txn, sparkSession)
          val operation = DeltaOperations.Write(SaveMode.Overwrite,
            Option(partitionColumns),
            options.replaceWhere)
          txn.commit(actions, operation)
        }
      case None => outputMode match {

如果是批写入,那么直接调用deltaLog开启一个新的事物,然后进行upsert操作。同时进行commit,然后就搞定了。

如果是流写入则麻烦一点,

case None => outputMode match {
        case Some(mode) =>
          val queryId = sparkSession.sparkContext.getLocalProperty(StreamExecution.QUERY_ID_KEY)
          assert(queryId != null)

          if (SchemaUtils.typeExistsRecursively(_data.schema)(_.isInstanceOf[NullType])) {
            throw DeltaErrors.streamWriteNullTypeException
          }

          val txn = deltaLog.startTransaction()
          // Streaming sinks can't blindly overwrite schema.
          // See Schema Management design doc for details
          updateMetadata(
            txn,
            _data,
            partitionColumns,
            configuration = Map.empty,
            false)

          val currentVersion = txn.txnVersion(queryId)
          val batchId = configuration(UpsertTableInDelta.BATCH_ID).toLong
          if (currentVersion >= batchId) {
            logInfo(s"Skipping already complete epoch $batchId, in query $queryId")
          } else {
            actions = upsert(txn, sparkSession)
            val setTxn = SetTransaction(queryId,
              batchId, Some(deltaLog.clock.getTimeMillis())) :: Nil
            val info = DeltaOperations.StreamingUpdate(outputMode.get, queryId, batchId)
            txn.commit(setTxn ++ actions, info)
          }
      }
    }

首选我们获取queryId,因为在delta里需要使用queryId获取事务ID(batchId),并且最后写完成之后的会额外写入一些数据到元数据里,也需要queryId。

updateMetadata 主要是为了检测schema信息,譬如如果stream 是complte模式,那么是直接覆盖的,而如果是其他模式,则需要做schema合并。

如果我们发现当前事务ID>batchId,说明这个已经运行过了,跳过。如果没有,则使用upsert进行实际的操作。最后设置一些额外的信息提交。

upsert 方法

upsert的基本逻辑是:

  1. 获取idCols是不是有分区字段,如果有,先根据分区字段过滤出所有的文件。

  2. 如果没有分区字段,则得到所有的文件

  3. 将这些文件转化为dataframe

  4. 和新写入的dataframe进行join操作,得到受影响的行(需要更新的行),然后得到这些行所在的文件。

  5. 获取这些文件里没有无需变更的记录,写成新文件。

  6. 删除这些文件

  7. 将新数据写成新文件

4,5两个步骤需要对数据进行join,但是在Spark里静态表并不能直接join流表,所以我们需要将流表转化为静态表。

def upsert(txn: OptimisticTransaction, sparkSession: SparkSession): Seq[Action] = {

    // if _data is stream dataframe, we should convert it to normal
    // dataframe and so we can join it later
    val data = if (_data.isStreaming) {
      class ConvertStreamDataFrame[T](encoder: ExpressionEncoder[T]) {

        def toBatch(data: Dataset[_]): Dataset[_] = {
          val resolvedEncoder = encoder.resolveAndBind(
            data.logicalPlan.output,
            data.sparkSession.sessionState.analyzer)
          val rdd = data.queryExecution.toRdd.map(resolvedEncoder.fromRow)(encoder.clsTag)
          val ds = data.sparkSession.createDataset(rdd)(encoder)
          ds
        }
      }
      new ConvertStreamDataFrame[Row](_data.asInstanceOf[Dataset[Row]].exprEnc).toBatch(_data)
    } else _data

上述代码就是将流表转化为普通静态表。接着我们需要拿到主键字段里满足分区字段的字段,然后获取他们的min/max值

val minMaxColumns = partitionColumnsInIdCols.flatMap { column =>
        Seq(F.lit(column), F.min(column).as(s"${column}_min"), F.max(F.max(s"${column}_max")))
      }.toArray
      val minxMaxKeyValues = data.select(minMaxColumns: _*).collect()

最后得到过滤条件:

// build our where statement
val whereStatement = minxMaxKeyValues.map { row =>
val column = row.getString(0)
val minValue = row.get(1).toString
val maxValue = row.get(2).toString

if (isNumber(column)) {
   s"${column} >= ${minValue} and   ${maxValue} >= ${column}"
} else {
   s"""${column} >= "${minValue}" and   "${maxValue}" >= ${column}"""
}

logInfo(s"whereStatement: ${whereStatement.mkString(" and ")}")
val predicates = parsePartitionPredicates(sparkSession, whereStatement.mkString(" and "))
Some(predicates)

现在可以得到所有相关的文件了:

val filterFilesDataSet = partitionFilters match {
      case None =>
        snapshot.allFiles
      case Some(predicates) =>
        DeltaLog.filterFileList(
          metadata.partitionColumns, snapshot.allFiles.toDF(), predicates).as[AddFile]
    }

将这些文件转化为dataframe,并且将里面的每条记录都带上所属文件的路径:

// Again, we collect all files to driver,
// this may impact performance and even make the driver OOM when
// the number of files are very huge.
// So please make sure you have configured the partition columns or make compaction frequently
val filterFiles = filterFilesDataSet.collect
val dataInTableWeShouldProcess = deltaLog.createDataFrame(snapshot, filterFiles, false)

val dataInTableWeShouldProcessWithFileName = dataInTableWeShouldProcess.
      withColumn(UpsertTableInDelta.FILE_NAME, F.input_file_name())

通过Join获取哪些文件里面的记录需要被更新:

// get all files that are affected by the new data(update)
val filesAreAffected = dataInTableWeShouldProcessWithFileName.join(data,
usingColumns = idColsList,
joinType = "inner").select(UpsertTableInDelta.FILE_NAME).
distinct().collect().map(f => f.getString(0))
val tmpFilePathSet = filesAreAffected.map(f => f.split("/").last).toSet

val filesAreAffectedWithDeltaFormat = filterFiles.filter { file =>
      tmpFilePathSet.contains(file.path.split("/").last)
}

val deletedFiles = filesAreAffectedWithDeltaFormat.map(_.remove)

将需要删除的文件里没有改变的记录单独拿出来写成新文件:

// we should get  not changed records in affected files and write them back again
val affectedRecords = deltaLog.createDataFrame(snapshot, filesAreAffectedWithDeltaFormat, false)

val notChangedRecords = affectedRecords.join(data,
usingColumns = idColsList, joinType = "leftanti").
drop(F.col(UpsertTableInDelta.FILE_NAME))
val notChangedRecordsNewFiles = txn.writeFiles(notChangedRecords, Some(options))

最后将我们新增数据写入:

val newFiles = txn.writeFiles(data, Some(options))

因为第一次写入的时候,schema还没有形成,所以不能走upsert逻辑,而是需要直接写入,这里我偷懒,没有把逻辑写在UpsertTableInDelta里,而是写在了MLSQLDeltaSink里:

override def addBatch(batchId: Long, data: DataFrame): Unit = {
    val metadata = deltaLog.snapshot.metadata
    val readVersion = deltaLog.snapshot.version
    val isInitial = readVersion < 0
    if (!isInitial && parameters.contains(UpsertTableInDelta.ID_COLS)) {
      UpsertTableInDelta(data, None, Option(outputMode), deltaLog,
        new DeltaOptions(Map[String, String](), sqlContext.sparkSession.sessionState.conf),
        Seq(),
        Map(UpsertTableInDelta.ID_COLS -> parameters(UpsertTableInDelta.ID_COLS),
          UpsertTableInDelta.BATCH_ID -> batchId.toString
        )).run(sqlContext.sparkSession)

    } else {
      super.addBatch(batchId, data)
    }
  }

总结

Delta 具备了数据的增删改查能力,同时流批共享,并发修改控制,加上小文件compaction功能,基本解决了我们之前在使用流计算遇到的大部分问题。后续持续优化delta的查询功能,相信前景无限。

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