斯坦福开源数据解析引擎Sparser:解析速度提升22倍

栏目: 服务器 · 发布时间: 6年前

内容简介:过滤之后再解析:用Sparser更快地分析原始数据很多大型数据应用程序通常在非结构化或半结构化的原始数据格式(如JSON)上运行。查询这些文件常常是非常耗时的,尤其是那些探索性应用程序,数据科学家用来运行查询以探索及更好地理解其数据。令人惊讶的是,这些应用程序实际上有80%-90%的执行时间是用于解析数据,而不是用于评估实际查询本身。因此,解析实际上才是瓶颈。我们将在本文中介绍

过滤之后再解析:用Sparser更快地分析原始数据

很多大型数据应用程序通常在非结构化或半结构化的原始数据格式(如JSON)上运行。查询这些文件常常是非常耗时的,尤其是那些探索性应用程序,数据科学家用来运行查询以探索及更好地理解其数据。令人惊讶的是,这些应用程序实际上有80%-90%的执行时间是用于解析数据,而不是用于评估实际查询本身。因此,解析实际上才是瓶颈。

我们将在本文中介绍 Sparser (请点击 这里 查看代码),它来自斯坦福DAWN团队最近的一个研究项目,该项目解决了这个性能瓶颈。Sparser的关键见解是,利用SIMD加速过滤函数在解析之前过滤数据。在JSON、Avro和Parquet数据上,Sparser的速度比最先进的解析器最多快22倍,并且能将Apache Spark中的端对端的查询运行时间最多提高9倍。

解析为什么那么慢?

在数据库社区中,原始数据流的解析很慢不是一个新问题。在2017年的VLDB大会上,微软的研究人员展示了 Mison ,这是一种新的JSON解析器,它利用SIMD命令在每个JSON记录上构建结构化的索引,从而在不完全反序列化记录的情况下实现高效的字段投影。尽管Misaon比之前最先进的解析器(如 RapidJSON )的速度有显著的提高,但是它仍然有很大的改进余地。当我们在JSON数据样本上测量Mison的解析吞吐量时,发现它平均每个字节仍然执行多个CPU周期。与简单的逐字节SIMD数据扫描相比(解析的理论上限),Mison的速度慢了几个数量级。

斯坦福开源数据解析引擎Sparser:解析速度提升22倍

使用最先进的解析器在L1缓存中解析单个5KB大小的 JSON记录所花费的CPU周期, 与在同一缓冲区中使用SIMD指令搜索单字节值的扫描比较。性能差异超过100倍。

将过滤器下推到解析器

Mison基于以前的解析器上的改进来自一个简单的想法:先投影再解析。也即,获取大多数用户指定的,在JSON数据查询中找到的投影,并且先投影再解析,从而只解析用户需要的必要字段。

受到Mison的启发,Sparser采用了一种类似的想法:假如我们把过滤器也下推到解析器,会怎样?这对于数据分析中的探索性查询来说,尤其有帮助,因为这些查询通常都具有高度选择性。比如,在读取JSON或CSV数据的Databrick的云设备上,当我们查看跟Spark SQL查询有关的分析元数据时,发现40%的查询选择了不到20%的记录。在研究人员对来自Censys(用于互联网端口扫描的搜索引擎)的JSON数据的查询上,我们进行了类似的分析,发现对这些查询甚至有更高的选择性。这个观察结果带来了优化解析的一个直观的想法:如果JSON记录不会出现在呈现给用户的最终结果中,那么我们就根本不该解析它!

斯坦福开源数据解析引擎Sparser:解析速度提升22倍

在读取JSON和CSV数据的Databricks上,来自Spark SQL的有选择性的CDF,和在Censys搜索引擎上,研究人员对JSON数据的查询。这两组查询都具有高度选择性。

Sparser:先过滤再解析

基于这个见解,Sparser把JSON和用户指定的 SQL 查询作为输入,通过以下步骤评估解析之后JSON文件上的查询:

  1. Sparser从查询中提取谓词,并把每个谓词编译成一个或多个原始过滤器(Raw Filter,简称RF)。RF是SIMD高效的过滤函数,可以遍历原始数据和丢弃记录;RF可以允许假阳性,但不允许假阴性。
  2. Sparser在所有候选RF上运行一个基于成本的优化器,并生成一个RF级联,也即一系列RF,这些RF可以最大化给定查询和原始数据的解析吞吐量。
  3. Sparser在原始数据上应用所选择的RF级联,并丢弃那些没有通过级联的记录。最后,其余的行传递给下游的解析器,如RapidJSON或Mison。

斯坦福开源数据解析引擎Sparser:解析速度提升22倍

左边:传统解析器。右边:Sparser, 利用快速的基于SIMD原始过滤器先过滤再解析,具有假阳性,但不具有假阴性。

因为Sparser的优化与先前的解析工作是正交的, 所以Sparser实际上是对其他解析器的补充,其中包括最先进的那些解析器,如Mison。此外,Sparser还推广到其他更结构化的数据形式,如Avro和Parquet。这些数据形式不依赖显式字符(如JSON中的‘{’和‘}’)来划分记录;因此,Mison的结构化索引技术(扫描这些字符)无法应用。

Sparser与现有技术的比较

为了衡量Sparser的有效性,首先,我们在一台机器上对它进行基准测试,与RapidJSON和Mison比较。我们从Censys下载了一个16GB大小的JSON记录,评估了9个不同选择度的查询,测量了它们使用每个解析器在用Sparser和不用Sparser情况下的运行时间。

斯坦福开源数据解析引擎Sparser:解析速度提升22倍 

在Censys数据集上,Sparser与RapidJSON和Mison的对比。在所有我们进行基准测试的9个查询上,Sparser最多把解析时间提高了22倍。

当与RapidJSON或Mison组合使用时,Sparser平均减少了大约1个数量级的解析时间,最多缩短了22倍。因为这些查询具有较低选择性,Sparser的原始过滤器可以有效地过滤那些不需要解析的记录,即使与Mison结合使用时也是如此。因此,原始过滤对于Mison的投影优化是个补充。

接下来,我们把Sparser与Apache Spark集成,并将它和Spark常用的Jackson JSON解析库结合起来。我们选择了更多的记录,这次有来自Censys的652GB大小的JSON记录,还有来自推特的68GB大小的推文。然后,对于每个数据集,我们对1)从磁盘下载数据所耗费的时间,2)在Spark SQL中端到端的查询运行时间,其中包括从磁盘加载数据的时间、解析数据的时间和评估查询的时间,3)查询评估运行时间本身进行基准测试。

斯坦福开源数据解析引擎Sparser:解析速度提升22倍

在推文查询(左侧)和Censys 查询(右侧)上,Spark + Sparser 与 Spark + Jackson的对比情况。Sparser将查询时间最多提高了9倍。实验是在10个节点GCE集群上的Spark 2.2中进行的。

对于4个推文查询,Sparser把端到端运行时间最多提高了9倍,而对于9个Censys查询,速度则最多提高了4倍。对于这两种情况而言,回复查询的时间仅仅比从磁盘加载文件所需时间多了一点。

最后,为了在Avro和Parquet上对Sparser进行基准测试,我们把一个小一些的推文数据集(32GB大小)转换成这两种格式,并对同样的4个推文查询进行基准测试。我们发现,即使对这些优化过的数据格式,Sparser还是可以加速查询速度,最多可以提高5倍。

斯坦福开源数据解析引擎Sparser:解析速度提升22倍

在Avro格式(左侧)和Parquet格式(右侧)上对推文查询使用Sparser的比较。Sparser分别将查询时间最多提高了5倍和4.3倍。

总结

简单回顾一下,Sparser是新的解析引擎,用于非结构化和半结构化的数据格式,例如JSON、Avro和Parquet。

Sparser:

  • 用原始过滤器过滤后再解析,丢弃那些不需要用假阳性率解析的记录
  • 用高效的优化器选择级联的原始过滤器
  • 提供超过现有解析器22倍的加速度

Sparser是开源软件,并且还在开发中;您可以看看我们在 GitHub上发布的alpha版本代码https://github.com/stanford-futuredata/sparser )。最近,我们在旧金山召开的 Spark+AI峰会 上演示了Sparser(相关录像 https://vimeo.com/274496506 )。我们将于8月30日(周四)在里约热内卢的 2018年VLDB大会 上再次演示Sparser。请查看我们 准备印制的论文http://www.vldb.org/pvldb/vol11/p1576-palkar.pdf )以获得更多信息;有其他问题的话,欢迎写邮件联络我们,电邮地址是shoumik@cs.standford.edu和fabuzaid@cs.standford.edu。

查看英文原文:

Filter Before You Parse: Faster Analytics on Raw Data with Sparser

https://dawn.cs.stanford.edu/2018/08/07/sparser/

感谢蔡芳芳对本文的审校及策划。


以上就是本文的全部内容,希望对大家的学习有所帮助,也希望大家多多支持 码农网

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